Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms