Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms