Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a1Q60737 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms