Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms