Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms