Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms