Protein–RNA interactions for Protein: Q60664

Lrmp, Lymphoid-restricted membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrmpQ60664 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LrmpQ60664 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LrmpQ60664 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LrmpQ60664 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LrmpQ60664 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LrmpQ60664 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LrmpQ60664 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LrmpQ60664 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LrmpQ60664 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LrmpQ60664 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LrmpQ60664 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms