Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpbQ60649 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms