Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr1h2Q60644 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr1h2Q60644 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1h2Q60644 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms