Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2f1Q60632 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms