Protein–RNA interactions for Protein: Q60629

Epha5, Ephrin type-A receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha5Q60629 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha5Q60629 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha5Q60629 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha5Q60629 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha5Q60629 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha5Q60629 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha5Q60629 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha5Q60629 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha5Q60629 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha5Q60629 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha5Q60629 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha5Q60629 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha5Q60629 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha5Q60629 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha5Q60629 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha5Q60629 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha5Q60629 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha5Q60629 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha5Q60629 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha5Q60629 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha5Q60629 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha5Q60629 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Epha5Q60629 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Epha5Q60629 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms