Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CttnQ60598 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CttnQ60598 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms