Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3aQ60520 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms