Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV7

Setd5, SET domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd5Q5XJV7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Setd5Q5XJV7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Setd5Q5XJV7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setd5Q5XJV7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setd5Q5XJV7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setd5Q5XJV7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setd5Q5XJV7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Setd5Q5XJV7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setd5Q5XJV7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setd5Q5XJV7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setd5Q5XJV7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setd5Q5XJV7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms