Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms