Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms