Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r196Q5SVD5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms