Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ggnbp2Q5SV77 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggnbp2Q5SV77 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ggnbp2Q5SV77 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms