Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms