Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms