Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r223Q5SSA0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms