Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms