Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms