Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms