Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms