Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.31■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.27■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.27■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1810065E05RikQ5NC41 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms