Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps41Q5KU39 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms