Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnni3kQ5GIG6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms