Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3558Q5FWC9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3558Q5FWC9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3558Q5FWC9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3558Q5FWC9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm3558Q5FWC9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm3558Q5FWC9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3558Q5FWC9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3558Q5FWC9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3558Q5FWC9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm3558Q5FWC9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3558Q5FWC9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3558Q5FWC9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3558Q5FWC9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3558Q5FWC9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm3558Q5FWC9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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