Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms