Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opa3Q505D7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms