Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otol1Q4ZJM7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms