Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc2Q4U2R1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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