Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syne3Q4FZC9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syne3Q4FZC9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms