Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shank3Q4ACU6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shank3Q4ACU6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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