Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Fam220aQ3ZN08 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam220aQ3ZN08 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Fam220aQ3ZN08 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Fam220aQ3ZN08 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Fam220aQ3ZN08 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Fam220aQ3ZN08 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Fam220aQ3ZN08 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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