Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms