Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930567H17RikQ3V0K5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms