Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms