Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm12888Q3UW77 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm12888Q3UW77 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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