Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms