Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms