Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms