Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28047Q3US59 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms