Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Acsf3Q3URE1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Acsf3Q3URE1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Acsf3Q3URE1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Acsf3Q3URE1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acsf3Q3URE1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Acsf3Q3URE1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Acsf3Q3URE1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms