Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlrc4Q3UP44 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms