Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cog7Q3UM29 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms