Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc33Q3ULW6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms