Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctsll3Q3ULP7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms