Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc106Q3ULM0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms